Центр коллективного пользования в области генетики МФТИ
О Центре
Центр коллективного пользования в области генетики (ЦКП «Прикладная генетика») создан 28 сентября 2020 года на основании приказа №48-6а (от 28.09.2020 г.). ЦКП является структурным подразделением Центра внедрения геномных технологий Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования «Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)».

Областью и предметом деятельности ЦКП «Прикладная генетика» является обеспечение фундаментальных и прикладных научных исследований в области биомедицины.

Руководитель ЦКП «Прикладная генетика» – Мелерзанов Александр Викторович, к. м. н.
Исполнительный директор Центра внедрения геномных технологий МФТИ - Гудков Денис Андреевич, к. х. н.
Перечень оказываемых услуг
Перечень выполняемых научных исследований и экспериментальных разработок на оборудовании Центра коллективного пользования в области генетики (ЦКП «Прикладная генетика»):
Секвенирование miSeq
Секвенирование по Сэнгеру
Исследование с использованием набора реагентов для выявления наследственных и соматических мутаций в ДНК, ассоциированных с риском развития рака МЖ и рака яичников, методом высокопроизводительного секвенирования на приборе MiSeq (Соло-тест ABC)
Исследование микробиоты методом 16s секвенирования на приборе miSeq
Электрофоретическое исследование образцов нуклеиновых кислот и белков
Проверка целостности РНК с помощью капиллярного электрофореза
Анализ распределения длин фрагментов ДНК с помощью капиллярного электрофореза
Измерение концентрации НК с помощью флуориметрии
Фрагментация ДНК с помощью ультразвука
Измельчение биообразцов с помощью гомогенизатора
Подготовка биоматериала с помощью микротома
Выделение ДНК/ РНК/ миРНК
Амплификация нуклеиновых кислот
Микроскопические исследования образцов
Сортировка клеток
Исследование пролиферации клеток
Хроматографическое разделение образцов
Хранение биоматериала в биобанке
Сертифицированные методики, используемые ЦКП «Прикладная генетика»:
Метод секвенирования фрагментов митохондриального генома животных и рыб для определения видовой принадлежности в однокомпонентной продукции (ГОСТ 34106–2017)
Элементы данных и их метаданные для описания структурированной информации о клиническом геномном секвенировании в электронных медицинских картах (ГОСТР 5 8 5 05–2019)
Микробиология пищевой продукции и кормов для животных. Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени для определения патогенных микроорганизмов. Горизонтальный метод определения бактерий Escherichia coli, продуцирующих Шига-токсин, в том числе серогрупп 0157, 0111, 026, 0103 и 0145 (ГОСТ ISO/TS 13136–2016)
Микробиология пищевой продукции и кормов для животных. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) для обнаружения и количественного учета патогенных микроорганизмов в пищевых продуктах. Технические характеристики (ГОСТ ISO 22118–2013)
Микробиология пищевой продукции и кормов для животных. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) для обнаружения и количественного учета патогенных микроорганизмов в пищевых продуктах. Общие требования и определения (ГОСТ Р 52833–2007)
Система показателей качества продукции. Микроскопы световые. Номенклатура показателей (ГОСТ 4.451–86)
Определение токсичности с использованием зеленых пресноводных одноклеточных водорослей (ГОСТ Р 54496–2011)
По всем вопросам, связанным с заказом услуг и сотрудничеством просьба писать: gudkov.da@mipt.ru / gc@mipt.ru
Проекты, выполняемые на базе или при участии ЦКП «Прикладная генетика»:
Внутренние:
  1. Разработка мультиплекс тест-системы на основе технологии ПЦР в реальном времени для определения вирусов COVID-19, гриппа A/B.
  2. Разработка методов метагеномных исследований с использованием технологии секвенирования нового поколения.
  3. Разработка платформы nFrAim для исследования нуклеиновых кислот, таргетного секвенирования ДНК и РНК, технологий неинвазивного пренатального тестирования на ее основе для диагностики наследственных патологий плода и других продуктов и технологий биоинформатики.
Внешние:
  1. Определение значений аллелей в STR локусах Y-хромосомы и аутосомных хромосомах, и определения нуклеотидной последовательности митохондриальной ДНК в образцах ДНК.
  2. Разработка технологии создания биомедицинского клеточного продукта для лечения обморожений, ожогов и ранений в условиях Арктики.
  3. Разработка нового продукта – инсектицидного аэрозоля для борьбы с резистентными тараканами.
  4. Оказание услуг по определению состава пищевых продуктов (образцов), предоставленных заказчиком.
  5. Проведение испытаний образцов в соответствии с Техническим заданием по согласованным Сторонами заявкам Заказчика.
    Публикации (с участием сотрудников ЦКП «Прикладная генетика»):
    1. Shabalina EY., Skorova EYu, Chudakova D.A. et. al. (2021) The matrix-dependent 3D spheroid model of the migration of non-small cell lung cancer: a step towards a rapid automated screening. Frontiers in Molecular Biosciences 8: 115
    2. Yudenko et al (2021) Rational Design of a Split Flavin-Based Fluorescent Reporter. ACS Synthetic Biology 10(1): 72-73
    3. Kim EL, Sorokin M, Kantelhardt SR et. al. (2020) Intratumoral Heterogeneity and Longitudinal Changes in Gene Expression Predict Differential Drug Sensitivity in Newly Diagnosed and Recurrent Glioblastoma. Cancers (Basel);12(2): 520
    4. Petersen E., Chudakova D., Skorova E. et. al. (2020) The extracellular matrix-derived biomarkers for diagnosis, prognosis, and personalized therapy of malignant tumours. Frontiers in Oncology 10: 2792
    5. Belov, S.V., Lobachevsky, Y.P., Danilejko (2020) The role of mitochondria in the dual effect of low-temperature plasma on human bone marrow stem cells: From apoptosis to activation of cell proliferation. Applied Sciences (Switzerland), 10(24): 1–14, 8971
    6. Temnov, A.A., Boyarintsev, V.V., Trofimenko et. al. (2020) Mesenchymal Stem Cells in the Treatment of Ischemia–Reperfusion Injuries. Human Physiology, 46(7): 741–745
    7. Ashurov, M.K., Belov, S.V., Gudkov, S.V. et. al. (2020) Effects of Low-Temperature Plasma Glow Discharge on the Proliferative Activity of Cells and the Repair Functions of Tissues in Animals and Plants. Biomedical Engineering, 53(6): 407–412
    8. Kessenikh A, Gnuchikh E, Bazhenov S. et. al. (2020) Genotoxic effect of 2,2'-bis(bicyclo[2.2.1] heptane) on bacterial cells. PLoS One 15(8): e0228525
    9. Marin E, Luginina A, Gusach A et al (2020) Small-wedge synchrotron and serial XFEL datasets for Cysteinyl leukotriene GPCRs. Sci Data 7: 388
    10. Kovalev K, Astashkin R, Gushchin I et al (2020) Molecular mechanism of light-driven sodium pumping. Nat Commun 11: 2137
    11. Aleksenko et al (2020) Phylogeny and structure of fatty acid photodecarboxylases and glucose-methanol-choline oxidoreductases. Catalysts 10(9): 1072
    12. Bazhenov SV, Khrulnova SA, Konopleva MN. et. al. (2019) Seasonal changes in luminescent intestinal microflora of the fish inhabiting the Bering and Okhotsk seas. FEMS Microbiol Lett. 366(4):fnz040
    13. Poddubskaya E., Baranova M., Allina D. et. al. (2019) Molecular pathway activation-based analysis for personalized prescription of tyrosine kinase inhibitors for advanced solid tumor patients. Journal of Clinical Oncology 37(15_suppl): e15636-e15636
    14. Gusach A., Luginina A. et al. (2019) Structural basis of ligand selectivity and disease mutations in cysteinyl leukotriene receptors. Nat Commun 10: 5573
    15. Goncharov, R.G., Rogov, K.A., Temnov, A.A. et. al. (2019) Protective role of exogenous recombinant peroxiredoxin 6 under ischemia-reperfusion injury of kidney. Cell and Tissue Research 378(2): 319–332
    16. Temnov, A.A., Rogov, K.A., Sklifas et. al. (2019) Protective properties of the cultured stem cell proteome studied in an animal model of acetaminophen-induced acute liver failure. Molecular Biology Reports 46(3): 3101–3112
    17. Temnov, A.A., Sklifas, A.N., Kukushkin et. al. (2019) The Effect of Polyoxyethylene–Polyoxypropylene Triblock Copolymers on the Loading Degree of Poly-(Lactic-co-Glycolic Acid) Copolymer-Based Microparticles Containing Chlorin e6 and Ethidium Bromide in Mesenchymal Stem Cells. Biophysics (Russian Federation) 64(2): 224–232
    18. Tereshchenko, A.V., Trifanenkova, I.G., Kodunov et. al. (2019) Effect of ligand peptides on post-burn inflammation of damaged corneal tissue in experiment. Acta Biomedica Scientifica. 4(4): 30–35
    19. Temnov, A.A., Boyarintsev, V.V., Trofimenko, A.V. et. al. (2019) Mesenchymal stem cells for treatment of ischemia reperfusion injuries. Aviakosmicheskaya i Ekologicheskaya Meditsina 53(5): 5–10
    20. Zelepukin IV, Yaremenko AV, Petersen EV et. al. (2019) Magnetometry based method for investigation of nanoparticle clearance from circulation in a liver perfusion model. Nanotechnology 30(10): 105101
    21. Luginina A, Gusach A, Marin E et. al. (2019) Structure-based mechanism of cysteinyl leukotriene receptor inhibition by antiasthmatic drugs. Sci Adv. 5(10): eaax2518
    22. Pokrovsky VS, Yu Anisimova N, Zh Davydov D. et. al. (2019) Methionine gamma lyase from Clostridium sporogenes increases the anticancer effect of doxorubicin in A549 cells and human cancer xenografts. Invest New Drugs 37(2): 201-209
    23. Albert EA, Puretskaia OA, Terekhanova NV et. al. (2018) Direct control of somatic stem cell proliferation factors by the Drosophila testis stem cell niche. Development. 145(17): dev156315
    24. Guller AE, Nadort A, Generalova AN. et. al. (2018) Rational Surface Design of Upconversion Nanoparticles with Polyethylenimine Coating for Biomedical Applications: Better Safe than Brighter? ACS Biomater Sci Eng. 4(9): 3143-31533
    25. Zhalimov, V., Sklifas, A., Kaptsov, V. et. al. (2018) The chemical structure of triblock copolymers and the adsorption capacity of perfluorocarbon—core nanoparticles stabilized by them. Colloid and Polymer Science 296(2): 251–257
    26. Temnov, A.A., Astrelina, T.A., Rogov, К.А. et. al. (2018) Investigation of the influence of the conditioning medium factors obtained during the cultivation of bone marrow mesenchymal stem cells on the course of severe local radiation injuries of skin in rats. Medical Radiology and Radiation Safety 63(1): 35–39
    27. Temnov, A., Astrelina, T., Rogov, K. et. al. (2018) A. Use of paracrine factors from stem cells to treat local radiation burns in rats. Stem Cells and Cloning: Advances and Applications 11: 69–76
    28. Sharapov, M.G., Gordeeva, A.E., Goncharov, R.G. et. al. (2017) The Effect of Exogenous Peroxiredoxin 6 on the State of Mesenteric Vessels and the Small Intestine in Ischemia–Reperfusion Injury. Biophysics (Russian Federation). 62(6): 998–1008
    29. Gordeeva, A.E., Sharapov, M.G., Tikhonova, I.V. et. al. (2017) Vascular Pathology of Ischemia/Reperfusion Injury of Rat Small Intestine. Cells Tissues Organs. 203(6): 353–364
    30. Temnov, A.A., Volkova, A.G., Melerzanov, A.V. et. al. (2017) Effect of conditioned medium from mesenchymal stem cells on regeneration of endothelium at HCl-induced damage trachea in rats. Patologicheskaia fiziologiia i eksperimental'naia terapiia. 61(2): 28–36
    31. Palutina, O.A., Sharapov, M.G., Temnov, A.A. et. al. (2016) Nephroprotective Effect Exogenous Antioxidant Enzymes during Ischemia/Reperfusion-Induced Damage of Renal Tissue. Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 160(3): 322–326
      Нормативные документы
      Руководитель ЦКП «Прикладная генетика»
      Мелерзанов Александр Викторович, к. м. н., gc@mipt.ru

      Контактное лицо: Исполнительный директор Центра внедрения геномных технологий МФТИ - Гудков Денис Андреевич, к. х. н., gudkov.da@mipt.ru, тел. +7(985)6635138

      Адрес размещения центра: г. Долгопрудный, Институтский пер., д. 9, к. 7
      © 2001-2022 Московский физико-технический институт
      (национальный исследовательский университет)